Redan vid misstanke om brott mot miljöbalkens bestämmelser är tillsynsmyndigheten skyldig att göra en åtalsanmälan. Tillsynsmyndigheten har inte möjlighet att göra någon bedömning av brottet i det enskilda fallet, utan det görs av miljöåklagaren som beslutar om ärendet ska gå vidare till åtal eller inte. För vissa överträdelser används miljösanktionsavgift som straff istället för åtalsanmälan.
Det är regeringen som beslutar vilka överträdelser som ska vara belagda med en sådan avgift samt hur stora miljösanktionsavgifterna ska vara. Miljösanktionsavgiften ska vara anpassad till överträdelsens allvar och pengarna tillfaller staten. Aktuella miljösanktionsavgifter finns i förordning (1998:950) om miljösanktionsavgifter.
Både privatpersoner och verksamhetsutövare kan behöva betala miljösanktionsavgift om de bryter mot miljöbalken eller förordningar och föreskrifter meddelade med stöd av balken. Viktigt att notera är att miljösanktionsavgift ska tas ut även om överträdelsen inte har skett uppsåtligen eller av oaktsamhet. När förutsättningar för miljösanktionsavgift har uppkommit ska miljösanktionsavgift påföras. Det är tillsynsmyndighetens skyldighet att besluta om miljösanktionsavgift. Om den avgiftsskyldige vidtar rättelse så innebär tyvärr inte detta att man slipper miljösanktionsavgift. Fortsätter överträdelsen eller om man upprepar samma överträdelse inom två år så blir miljösanktionsavgiften dubbelt så hög.
Beslut om miljösanktionsavgift kan överklagas till Miljödomstolen. Information om hur en överklagan går till skickas med beslutet. En miljösanktionsavgift ska betalas till Kammarkollegiet inom 30 dagar från delgivning av beslutet. Observera att avgiften ska betalas även om man överklagar. Får man rätt i Miljödomstolen betalas avgiften tillbaka med ränta.
Följande är dessvärre inte skäl för tillsynsmyndigheten att efterge avgiften:
- Att man inte har känt till de regler som gäller
- En uppdragstagare som har anlitats har begått ett misstag eller inte gjort vad som kunnat förväntas eller vad som utlovats
- En verksamhet är nystartad
- Man har glömt eller inte haft tid
- Den avgiftsskyldige har haft dåliga rutiner
- Man har ekonomiska problem
- Avgiften är hög i förhållande till den avgiftsskyldiges ekonomiska förhållanden
Tillsynsmyndigheten kan dock besluta om en längre betalningstid eller uppdelning av betalningen om den avgiftsskyldige åberopar bristande betalningsförmåga och kan visa detta för myndigheten.